Paket: cwltool (3.0.20210124104916-3+deb11u1)

[ Quellcode: cwltool  ]

Referenzimplemantation der Common Workflow Language

Dieses Paket beinhaltet die Referenzimplementierung des Common Workflow Language Standards.

Der offene Standard CWL beschreibt Analyse-Workflows und Werkzeuge mit dem Ziel der Portier- und Skalierbarkeit für eine Vielzahl von Soft- und Hardware, von Workstations bis zu Clustern, Cloud und High Performance Computing (HPC) Umgebungen. CWL wurde für die Anforderungen bei hohem Datenaufkommen entworfen, wie sie in der Bioinformatik, der medizinischen Bildverarbeitung, der Astronomie, Physik und Chemie vorkommen.

Der Anspruch der Referenzimplementierung (cwltool) ist es, alle Aspekte des Standards umzusetzen und eine vollständige Validierung von CWL-Dateien zu bieten sowie weitere Werkzeuge für das Arbeiten mit CWL-Beschreibungen.

Markierungen: System-Administration: Automatisierung und Planung, Virtualisierung, Feld: field::astronomy, field::biology, field::biology:bioinformatics, field::biology:molecular, Strukturelle Biologie, field::medicine, field::physics, Implementiert in: Python, Benutzer-Schnittstellen: interface::commandline, role::program, Wissenschaft: Berechnung, Zweck: Hilfswerkzeug, Class of system: system::cloud, system::laptop, Server, Virtual, Zweck: use::analysing, use::filtering, Unterstützt Formate: Benötige eine zusätzliche Markierung, Arbeitet mit: works-with::semantic-data, works-with::software:package

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• sug: docker.io

  Laufzeit für Linux-Container

  oder singularity-container

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