Paket: phybin (0.3-5)

[ Quellcode: phybin  ]

binning/clustering newick trees by topology

PhyBin is a simple command line tool that classifies a set of Newick tree files by their topology. The purpose of it is to take a large set of tree files and browse through the most common tree topologies.

It can do simple binning of identical trees or more complex clustering based on an all-to-all Robinson-Foulds distance matrix.

phybin produces output files that characterize the size and contents of each bin or cluster (including generating GraphViz-based visual representations of the tree topologies).

Andere Pakete mit Bezug zu phybin

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libffi7 (>= 3.3~20180313)

  Fremdes Funktionsinterface, Laufzeitbibliothek

• dep: libgmp10

  Mehrfachgenaue, arithmetische Bibliothek

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Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
ppc64el	3.395,8 kB	37.296,0 kB	[Liste der Dateien]