Paket: gromacs-mpich (2020.6-2)

[ Quellcode: gromacs  ]

Molecular dynamics sim, binaries for MPICH parallelization

GROMACS is a versatile package to perform molecular dynamics, i.e. simulate the Newtonian equations of motion for systems with hundreds to millions of particles.

It is primarily designed for biochemical molecules like proteins and lipids that have a lot of complicated bonded interactions, but since GROMACS is extremely fast at calculating the nonbonded interactions (that usually dominate simulations) many groups are also using it for research on non- biological systems, e.g. polymers.

This package contains only the core simulation engine with parallel support using the MPICH (v3) interface. It is suitable for nodes of a processing cluster, or for multiprocessor machines.

Markierungen: Software-Entwicklung: C-Entwicklung, Bibliotheken, Feld: Biologie, field::chemistry, implemented-in::c, Benutzer-Schnittstellen: Kommandozeile, Rolle: role::devel-lib, role::program, Zweck: Hilfswerkzeug, Arbeitet mit: Paketierte Software

Andere Pakete mit Bezug zu gromacs-mpich

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libfftw3-double3 (>= 3.3.5)

  Bibliothek zur Berechnung Schneller Fourier-Transformationen (doppelte Genauigkeit)

• dep: libfftw3-single3 (>= 3.3.5)

  Bibliothek zur Berechnung Schneller Fourier-Transformationen (einfache Genauigkeit)

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  Unterstützungsbibliothek für GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libhwloc15 (>= 2.4.1+dfsg)

  Hierarchische Ansicht des Rechners - Laufzeitbibliotheken

• dep: libmpich12 (>= 3.4.1)

  Shared libraries for MPICH

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: mpich

  Implementation of the MPI Message Passing Interface standard

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0)

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

• rec: gromacs

  Simulator für Moleküldynamik, Werkzeuge für das Erstellen der Modelle und deren Analyse

• sug: gromacs-data

  Daten und Dokumentation für GROMACS, einen Simulator für Moleküldynamik

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ppc64el	4.390,0 kB	14.645,0 kB	[Liste der Dateien]