Paket: libhts-dev (1.11-4)
Links für libhts-dev
Debian-Ressourcen:
Quellcode-Paket htslib herunterladen:
Betreuer:
- Debian Med Packaging Team (QS-Seite, E-Mail-Archiv)
- Charles Plessy (QS-Seite)
- Andreas Tille (QS-Seite)
- Michael R. Crusoe (QS-Seite)
- Steffen Moeller (QS-Seite)
Externe Ressourcen:
- Homepage [github.com]
Ähnliche Pakete:
C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate - Entwicklungsdateien
HTSlib ist eine Implementierung einer vereinheitlichten C-Bibliothek für den Zugriff auf gängige Dateiformate, wie SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM und VCF (Variant Call Format), die für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdaten verwendet werden, und ist die von samtools und bcftools verwendete Kernbibliothek. HTSlib hängt nur von zlib ab. Es ist bekannt, dass sie mit gcc, g++ und clang kompatibel ist.
HTSlib implementiert einen verallgemeinerten BAM-Index (binary SAM) mit der Dateierweiterung »csi« (coordinate-sorted index). Der HTSlib-Dateileser sucht zuerst nach dem neuen Index und dann nach dem alten, wenn der neue Index nicht vorhanden ist.
Dieses Paket enthält Entwicklungsdateien für die HTSlib: Header, statische Bibliothek, Handbuchseiten, etc.
Aus Gründen der Kompatibilität mit sambamba wurde die interne Routine cram_to_bam exportiert, wobei ein in guix gefundener Patch übernommen wurde.
Andere Pakete mit Bezug zu libhts-dev
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libhts-dev herunterladen
| Architektur | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
|---|---|---|---|
| mips64el | 3.786,8 kB | 5.233,0 kB | [Liste der Dateien] |