Paket: snakemake (5.24.1-2)

[ Quellcode: snakemake  ]

pythonic workflow management system

Build systems like GNU Make are frequently used to create complicated workflows, e.g. in bioinformatics. This project aims to reduce the complexity of creating workflows by providing a clean and modern domain specific language (DSL) in Python style, together with a fast and comfortable execution environment.

Andere Pakete mit Bezug zu snakemake

• dep: ca-certificates

  Häufig genutzte Zertifizierungsstellen

• dep: libjs-bootstrap

  HTML-, CSS- und JavaScript-Rahmenwerk

• dep: libjs-d3

  JavaScript-Visualisierungsbibliothek für HTML und SVG

• dep: libjs-jquery

  JavaScript-Bibliothek für dynamische Webanwendungen

• dep: libjs-mathjax

  JavaScript-Engine zur Anzeige von LaTeX und MathML

• dep: libjs-sphinxdoc (>= 2.4.3-5~)

  JavaScript-Unterstützung für Sphinx-Dokumentation

• dep: node-dagre-d3-renderer

  D3-based renderer for Dagre

• dep: python3

  Interaktive objektorientierte Hochsprache (Python3-Standardversion)

• dep: python3-appdirs

  determining appropriate platform-specific directories (Python 3)

• dep: python3-configargparse

  Ersatz für argparse mit Konfigurationsdateien und Umgebungsvariablen (Python 3)

• dep: python3-datrie

  Super-fast, efficiently stored Trie for Python 3

• dep: python3-docutils

  Textverarbeitungssystem für reStructuredText (Python-3-Implementierung)

• dep: python3-git

  Python library to interact with Git repositories - Python 3.x

• dep: python3-jsonschema

  Eine (andere) Implementierung von JSON Schema (Draft 3 und 4) - Python 3.x

• dep: python3-nbformat

  Das Jupyter-Notebook-Format (Python 3)

• dep: python3-pkg-resources

  Paketermittlung und Ressourcenzugriff mittels pkg_resources

• dep: python3-psutil

  Modul mit komfortablen Funktionen für die Prozessverwaltung (Python 3)

• dep: python3-pulp (<< 2.0~)

  LP modeler - Python 3.x

• dep: python3-ratelimiter

  simple Python library for limiting the rate of operations

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  Elegante und einfache Python-3-HTTP-Bibliothek, für Menschen gebaut

• dep: python3-toposort

  topological sort algorithm - Python 3 module

• dep: python3-wrapt

  Decorators, Wrapper und »monkey patches« - Python 3.x

• dep: python3-yaml

  Python3-Parser und -Emitter für YAML

• dep: sphinx-rtd-theme-common (>= 0.5.1+dfsg)

  sphinx theme from readthedocs.org (common files)

• rec: cwltool

  Referenzimplemantation der Common Workflow Language

• rec: imagemagick

  Bildbearbeitungsprogramme - Binärprogramme
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch graphicsmagick-imagemagick-compat, imagemagick-6.q16

• rec: python3-azure-storage

  Microsoft Azure Storage Library for Python 3.x

• rec: python3-biopython

  Python-3-Bibliothek für die Bioinformatik

• rec: python3-boto3

  Python interface to Amazon's Web Services - Python 3.x

• rec: python3-botocore

  Low-level, data-driven core of boto 3 (Python 3)

• rec: python3-drmaa

  Paket nicht verfügbar

• rec: python3-dropbox

  Official Dropbox API Client (Python3 version)

• rec: python3-flask

  Web-Rahmenwerk auf Grundlage von Werkzeug und Jinja2 - Python 3.x

• rec: python3-ftputil

  high-level FTP client library for Python

• rec: python3-irodsclient

  Client API for iRods

• rec: python3-jinja2

  Eigenständiges, kleines, aber schnelles und einfach bedienbares Vorlagenprogramm

• rec: python3-kubernetes

  Kubernetes Python client - Python 3.x

• rec: python3-networkx

  Werkzeug zum Erstellen, Manipulieren und Studieren komplexer Netzwerke (Python 3)

• rec: python3-pygments

  Python-3-Paket zur Syntaxhervorhebung

• rec: python3-pygraphviz

  Python interface to the Graphviz graph layout and visualization package (Python 3)

• rec: python3-tz

  Python-3-Version der Olson-Zeitzonendatenbank

• rec: python3-urllib3

  Python-3-HTTP-Bibliothek mit thread-sicherer Wiederverwendung von Verbindungen

• rec: python3-yappi

  Yet Another Python Profiler - Python 3.x

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Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
all	5.964,1 kB	21.382,0 kB	[Liste der Dateien]