Paket: ray (2.3.1-7)

[ Quellcode: ray  ]

De-novo-Genomassemblierung von »Next Generation Sequencing«-Daten

Ray ist eine Parallelsoftware zur Berechnung von De-novo-Genomassemblierungen mithilfe von durch Next Generation Sequencing gewonnenen Daten. Die Software ist in C++ geschrieben und kann parallel auf mehreren miteinander verbundenen Computern laufen. Sie nutzt den MPI-Standard (message-passing interface).

Ray beinhaltet:

 - Ray        De-novo-Assemblierung einzelner Genome
 - Ray Méta   De-novo-Assemblierung von Metagenomen
 - Ray Communities  Mikrobenfülle + taxonomisches Profiling
 - Ray Ontologies   Gen-Ontologie-Profiling

Andere Pakete mit Bezug zu ray

• dep: libbz2-1.0

  Hochwertiger, Blöcke sortierender Dateikomprimierer - Laufzeitbibliothek

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:4.2)

  Paket nicht verfügbar

• dep: libopenmpi3 (>= 4.0.2)

  Leistungsstarke Message-Passing-Bibliothek - Laufzeitbibliotheken

• dep: libstdc++6 (>= 9)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: mpi-default-bin

  Standard-MPI-Laufzeitdateien (Metapaket)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

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Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
i386	896,3 kB	2.525,0 kB	[Liste der Dateien]