Paket: plink1.9 (1.90~b6.21-201019-1)

[ Quellcode: plink1.9  ]

Werkzeugsatz für die Analyse von Zusammenhängen im gesamten Genom

Plink erwartet als Eingabe die Daten aus SNP-Chips (Single Nucleotide Polymorphismus) von vielen einzelnen Individuen und deren phänotypische Beschreibung einer Krankheit. Das Programm findet Verbindungen von einzelnen oder Paaren von DNA-Varianten mit einem Phänotyp. Es kann SNP-Erläuterungen aus einer Online-Quelle abrufen.

SNPs können einzeln oder als Paar auf ihren Zusammenhang mit Krankheitsphänotypen bewertet werden. Die gemeinsame Untersuchung von Varianten von Genkopien wird unterstützt. Eine Vielzahl von statistischen Tests wurde implementiert.

Plink1.9 ist eine umfassende Aktualisierung von plink mit neuen Algorithmen und neuen Methoden, schneller und sparsamer im Speicherverbrauch als das erste plink.

Bitte beachten Sie: Die ausführbare Anwendung wurde wegen eines Namenskonflikts zu plink1.9 umbenannt. Mehr dazu unter /usr/share/doc/plink1.9/README.Debian.

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Implementiert in: implemented-in::c, interface::commandline, Rolle: Programm, Zweck: Analyse

Andere Pakete mit Bezug zu plink1.9

• dep: libblas3

  Grundlegende Unterprogramme für Lineare Algebra, gemeinsame Bibliothek

  oder libblas.so.3

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch libatlas3-base, libblas3, libblis3-openmp, libblis3-pthread, libblis3-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 4.2)

  GCC Support-Bibliothek

• dep: liblapack3

  Bibliothek von Routinen für Lineare Algebra (3) - gemeinsame Version

  oder liblapack.so.3

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

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Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
i386	871,7 kB	2.366,0 kB	[Liste der Dateien]