Paket: gwama (2.2.2+dfsg-4)

[ Quellcode: gwama  ]

Metaanalysen für genomweite Assoziationen

Die Software GWAMA (Genome-Wide Association Meta Analysis) führt Metaanalysen der Resultate von genomweiten Assoziationsstudien (GWAS) binärer oder quantitativer Phänotypen durch. Fixed- und Random-Effect-Metaanalysen werden sowohl für direkt genotypisierte als auch zugerechnete SNPs durchgeführt. Dabei werden Schätzungen des Verhältnisses der Allel-Wahrscheinlichkeiten und ein 95%-Konfidenzintervall für binäre Eigenschaften sowie Schätzungen der Größe von Allel-Effekten und Standardfehlern für quantitative Phänotypen verwendet. GWAMA kann für die Analyse von Resultaten aller unterschiedlichen genetischen Modelle (multiplikativ, additiv, dominant, rezessiv) verwendet werden. Die Software beinhaltet Möglichkeiten zur Ausnahmebehandlung, um Fehler in der Strangausrichtung und »allele flipping« zu entdecken, sowie um Tests zur Heterogenität von Effekten zwischen Studien durchzuführen.

Andere Pakete mit Bezug zu gwama

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht armel, armhf, ppc64el]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	81,3 kB	273,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	69,3 kB	233,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	71,7 kB	248,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	68,3 kB	184,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	80,5 kB	272,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	72,1 kB	282,0 kB	[Liste der Dateien]
mipsel	73,3 kB	284,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	78,7 kB	309,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	69,8 kB	253,0 kB	[Liste der Dateien]