Paket: fastaq (3.17.0-3)

Links für fastaq

Debian-Ressourcen:

Quellcode-Paket fastaq herunterladen:

Betreuer:

Debian Med Packaging Team (QS-Seite, E-Mail-Archiv)
Andreas Tille (QS-Seite)
Jorge Soares (QS-Seite)
Sascha Steinbiss (QS-Seite)

Externe Ressourcen:

Homepage [github.com]

FASTA and FASTQ file manipulation tools

Fastaq represents a diverse collection of scripts that perform useful and common FASTA/FASTQ manipulation tasks, such as filtering, merging, splitting, sorting, trimming, search/replace, etc. Input and output files can be gzipped (format is automatically detected) and individual Fastaq commands can be piped together.

Markierungen: Biologie: Fasta/Pearson, Nukleinsäuren, Feld: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implementiert in: implemented-in::python, interface::commandline, Rolle: Programm, Zweck: Hilfswerkzeug, Zweck: use::analysing, use::calculating, Überprüfen, Daten-Konvertierung, use::filtering, works-with::biological-sequence

Andere Pakete mit Bezug zu fastaq

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: python3

Interaktive objektorientierte Hochsprache (Python3-Standardversion)
dep: python3-pkg-resources

Paketermittlung und Ressourcenzugriff mittels pkg_resources
dep: samtools

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

fastaq herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
all	46,7 kB	196,0 kB	[Liste der Dateien]