Paket: plink (1.07+dfsg-3)

Links für plink

Debian-Ressourcen:

Quellcode-Paket plink herunterladen:

Betreuer:

Debian Med Packaging Team (QS-Seite, E-Mail-Archiv)
Steffen Moeller (QS-Seite)
Andreas Tille (QS-Seite)
Charles Plessy (QS-Seite)
Dylan Aïssi (QS-Seite)

Externe Ressourcen:

Homepage [zzz.bwh.harvard.edu]

Werkzeugsatz für die Analyse von Zusammenhängen im gesamten Genom

Plink erwartet als Eingabe die Daten aus SNP-Chips (Single Nucleotide Polymorphismus) von vielen einzelnen Individuen und deren phänotypische Beschreibung einer Krankheit. Das Programm findet Verbindungen von einzelnen oder Paaren von DNA-Varianten mit einem Phänotyp. Es kann SNP-Erläuterungen aus einer Online-Quelle abrufen.

SNPs können einzeln oder als Paar auf ihren Zusammenhang mit Krankheitsphänotypen bewertet werden. Die gemeinsame Untersuchung von Varianten von Genkopien wird unterstützt. Eine Vielzahl von statistischen Tests wurde implementiert.

Bitte beachten Sie: Die ausführbare Anwendung wurde wegen eines Namenskonflikts zu plink1 umbenannt. Mehr dazu unter /usr/share/doc/plink/README.Debian.

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Implementiert in: implemented-in::c++, interface::commandline, Rolle: Programm, Zweck: Analyse

Andere Pakete mit Bezug zu plink

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libc6 (>= 2.29)

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
dep: libcrypt1 (>= 1:4.1.0)

Laufzeitbibliothek libcrypt
dep: libgcc1 (>= 1:3.5)

Paket nicht verfügbar
dep: libstdc++6 (>= 9)

GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

rec: med-config (>= 2.1)

Debian Med - allgemeines Konfigurationspaket

plink herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
armel	985,3 kB	2.964,0 kB	[Liste der Dateien]