Paket: pplacer (1.1~alpha19-4)

[ Quellcode: pplacer  ]

phylogenetic placement and downstream analysis

Pplacer places reads on a phylogenetic tree. guppy (Grand Unified Phylogenetic Placement Yanalyzer) yanalyzes them. rppr is a helpful tool for working with reference packages.

Pplacer places query sequences on a fixed reference phylogenetic tree to maximize phylogenetic likelihood or posterior probability according to a reference alignment. Pplacer is designed to be fast, to give useful information about uncertainty, and to offer advanced visualization and downstream analysis.

Andere Pakete mit Bezug zu pplacer

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libgsl25 (>= 2.6)

  GNU Scientific Library -- Bibliothekspaket

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.25.0)

  Laufzeit-Bibliothek für SQLite 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
arm64	3.421,1 kB	20.802,0 kB	[Liste der Dateien]