Paket: megahit (1.2.9-2)

[ Quellcode: megahit  ]

ultra-fast and memory-efficient meta-genome assembler

Megahit is an ultra-fast and memory-efficient NGS assembler. It is optimized for metagenomes, but also works well on generic single genome assembly (small or mammalian size) and single-cell assembly.

The software was praised in a Briefings in Bioinformatics 5/2020 review (DOI: 10.1093/bib/bbaa085).

Andere Pakete mit Bezug zu megahit

• dep: bzip2

  Hochwertiger, Blöcke sortierender Dateikomprimierer - Dienstprogramme

• dep: libc6 (>= 2.14)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libgomp1 (>= 6)

  Unterstützungsbibliothek für GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 7)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: python3

  Interaktive objektorientierte Hochsprache (Python3-Standardversion)

• dep: python3-all

  Paket, abhängig von allen unterstützten Versionen der Python-3-Laufzeitumgebungen

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

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Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	1.011,9 kB	7.983,0 kB	[Liste der Dateien]