Paket: sambamba (1.0+dfsg-1)

[ Quellcode: sambamba  ]

tools for working with SAM/BAM data

Sambamba positions itself as a performant alternative to samtools and provides tools for

 * Powerful filtering with sambamba view --filter
 * Picard-like SAM header merging in the merge tool
 * Optional for operations on whole BAMs
 * Fast copying of a region to a new file with the slice tool
 * Duplicate marking/removal, using the Picard criteria

Andere Pakete mit Bezug zu sambamba

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  GCC Support-Bibliothek

• dep: liblz4-1 (>= 0.0~r127)

  Schnelle Bibliothek für den LZ-Komprimierungsalgorithmus - Laufzeit

• dep: libphobos2-ldc-shared100 (>= 1:1.30.0)

  LLVM D Compiler - Standard and runtime libraries

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

sambamba herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	602,0 kB	2.711,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	526,4 kB	2.571,0 kB	[Liste der Dateien]