Paket: arden (1.0-5)

[ Quellcode: arden  ]

Genaue Kontrolle für das Lesen von Alignierungen unter Verwendung einer künstlichen Intelligenz

ARDEN (Artificial Reference Driven Estimation of false positives in NGS data) ist für DNA-Sequenzierung der nächsten Generation ein neuartiges Bewertungsprogramm zum Abschätzen von Fehlerraten basierend auf experimentell gewonnenen DNA-Fragmenten (reads) und einem zusätzlich generierten künstlichem Genom. Es ermöglicht die Berechnung von Fehlerraten von einem spezifizierten Datensatz und die Konstruktion einer ROC-Kurve. Nebenbei kann es für die Optimierung von Parametern für read mappers, zur Auswahl von read mappers für ein spezifisches Problem oder zum Filtern von Alignierungen basierend auf Qualitätsabschätzungen genutzt werden.

Andere Pakete mit Bezug zu arden

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: python3-htseq

  Python3 high-throughput genome sequencing read analysis utilities

• dep: python3-matplotlib

  Python-3-System ähnlich Matlab zur Ausgabe von Zeichnungen

• dep: python3-numpy

  Schnelle Array-Einrichtung für die Sprache Python 3

• dep: python3-scipy

  Wissenschaftliche Werkzeuge für Python 3

arden herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
all	87,2 kB	1.156,0 kB	[Liste der Dateien]