Paket: tabix (1.16+ds-3)

Links für tabix

Debian-Ressourcen:

Quellcode-Paket htslib herunterladen:

Betreuer:

Debian Med Packaging Team (QS-Seite, E-Mail-Archiv)
Charles Plessy (QS-Seite)
Andreas Tille (QS-Seite)
Michael R. Crusoe (QS-Seite)
Steffen Moeller (QS-Seite)
Étienne Mollier (QS-Seite)

Externe Ressourcen:

Homepage [github.com]

generic indexer for TAB-delimited genome position files

Tabix indexes files where some columns indicate sequence coordinates: name (usually a chromosome), start and stop. The input data file must be position sorted and compressed by bgzip (provided in this package), which has a gzip like interface. After indexing, tabix is able to quickly retrieve data lines by chromosomal coordinates. Fast data retrieval also works over network if an URI is given as a file name.

This package is built from the HTSlib source, and provides the bgzip, htsfile, and tabix tools.

Markierungen: Implementiert in: C, Rolle: Programm, Wissenschaft: science::calculation, use::calculating, Unterstützt Formate: HTML, Hypertext Markup Language (Hypertext-Auszeichnungssprache), Arbeitet mit: Text

Andere Pakete mit Bezug zu tabix

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libbz2-1.0

Hochwertiger, Blöcke sortierender Dateikomprimierer - Laufzeitbibliothek
dep: libc6 (>= 2.34)

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
dep: libdeflate0 (>= 1.0)

Schnelle DEFLATE-basierte Komprimierung und Dekomprimierung im gesamten Puffer
dep: libhtscodecs2 (>= 1.3.0)

Custom compression for CRAM and others
dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

Bibliothek für das XZ-Kompressionsformat
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

tabix herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
ppc64el	481,2 kB	2.945,0 kB	[Liste der Dateien]