Paket: altree (1.3.2-1 und andere)

[ Quellcode: altree  ]

Programm zur Phylogenie-basierten Assoziations- und Lokalisierungsanalyse

ALTree wurde für entworfen, um Assoziationen zu entdecken und Suszeptibilitäts-Lokuse (susceptibility loci) mittels phylogenetischen Bäumen aus Haplotypen zu lokalisieren. Zum Einen ermöglicht sie die Entdeckung einer Assoziation zwischen einem untersuchten Gen und einer Krankheit, zum Anderen wird eine Hypothese über Suszeptibilitäts-Lokuse möglich.

Markierungen: Software-Entwicklung: Perl-Entwicklung, Bibliotheken, Feld: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implementiert in: C, implemented-in::perl, interface::commandline, Rolle: Entwicklungs-Bibliothek, role::program, role::shared-lib, Zweck: Hilfswerkzeug, Zweck: Analyse, use::comparing, works-with-format::TODO, Unterstützt Formate: Reiner Text, Arbeitet mit: Benötige eine zusätzliche Markierung

Andere Pakete mit Bezug zu altree

• dep: libblas3

  Grundlegende Unterprogramme für Lineare Algebra, gemeinsame Bibliothek

  oder libblas.so.3

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libgsl27 (>= 2.7.1)

  GNU Scientific Library -- Bibliothekspaket

• dep: libmath-tamuanova-perl

  Perl extension for the tamuanova library

• dep: perl (>= 5.36.0-4)

  Larry Wall's Practical Extraction und Report Language

• dep: perlapi-5.36.0

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch perl-base

• rec: libopenblas0

  Optimized BLAS (linear algebra) library (meta)

  oder libatlas3-base

  Automatisch optimierte Software für Lineare Algebra, generische Bibliotheken

  oder libmkl-rt

  Intel® MKL: Single Dynamic Library (SDL)

  oder libblas.so.3

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• sug: altree-examples

  Beispieldateien für ALTree

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Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
ppc64el	1.3.2-1+b3	340,6 kB	635,0 kB	[Liste der Dateien]