Paket: fastqtl (2.184+v7+dfsg-3)

[ Quellcode: fastqtl  ]

Quantitative Trait Loci (QTL) mapper in cis for molecular phenotypes

The goal of FastQTL is to identify single-nucleotide polymorphisms (SNPs) which are significantly associated with various molecular phenotypes (i.e. expression of known genes, cytosine methylation levels, etc). It performs scans for all possible phenotype-variant pairs in cis (i.e. variants located within a specific window around a phenotype). FastQTL implements a new permutation scheme (Beta approximation) to accurately and rapidly correct for multiple-testing at both the genotype and phenotype levels.

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Benutzer-Schnittstellen: interface::commandline, role::program, Zweck: Analyse

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• dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0)

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  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
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  QTL mapper in cis for molecular phenotypes - documentation

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