Paket: ont-fast5-api (4.1.1+dfsg-2 und andere)

[ Quellcode: ont-fast5-api  ]

simple interface to HDF5 files of the Oxford Nanopore .fast5 file format

Ont_fast5_api is a simple interface to HDF5 files of the Oxford Nanopore .fast5 file format.

It provides:

 * Concrete implementation of the fast5 file schema using the generic h5py
   library
 * Plain-english-named methods to interact with and reflect the fast5 file
   schema
 * Tools to convert between multi_read and single_read formats
 * Tools to compress/decompress raw data in files

Andere Pakete mit Bezug zu ont-fast5-api

• dep: libc6 (>= 2.4)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libstdc++6 (>= 4.4)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: libvbz-hdf-plugin-dev

  VBZ compression plugin for nanopore signal data (devel)

• dep: libzstd1 (>= 1.5.2)

  Schneller verlustfreier Komprimierungsalgorithmus

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.12)

  dep: python3 (>= 3.11~)

• dep: python3-h5py

  general-purpose Python interface to hdf5

• dep: python3-numpy

  Schnelle Array-Einrichtung für die Sprache Python 3

• dep: python3-packaging

  Kern-Dienstprogramme für Python3-Pakete

• dep: python3-progressbar

  text progress bar library for Python (Python 3)

ont-fast5-api herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
mips64el	4.1.1+dfsg-2+b1	48,0 kB	279,0 kB	[Liste der Dateien]