Paket: qtltools (1.3.1+dfsg-4)

[ Quellcode: qtltools  ]

Tool set for molecular QTL discovery and analysis

QTLtools is a tool set for molecular Quantitative Trait Loci (QTL) discovery and analysis. It allows user to go from the raw sequence data to collection of molecular QTL in few easy-to-perform steps. QTLtools contains multiple methods to prepare the data, to discover proximal and distal molecular QTL and to finally integrate them with GWAS variants and functional annotations of the genome.

Andere Pakete mit Bezug zu qtltools

• dep: libblas3

  Grundlegende Unterprogramme für Lineare Algebra, gemeinsame Bibliothek

  oder libblas.so.3

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0)

  Boost.Iostreams-Bibliothek

• dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0)

  C++-Bibliothek für Programmoptionen

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 4.2)

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libgsl27 (>= 2.7.1)

  GNU Scientific Library -- Bibliothekspaket

• dep: libhts3 (>= 1.10)

  C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: r-base-core

  GNU R - System für statistische Berechnungen und Grafik - Kern

• dep: r-mathlib (>= 4.2.2.20221110)

  Eigenständige Mathematikbibliothek für GNU R

• rec: r-bioc-qvalue

  »GNU R«-Paket zur Q-Wert-Bestimmung für FDR-Steuerung

• sug: qtltools-example

  Tool set for molecular QTL discovery and analysis - example

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