Paket: embassy-domalign (0.1.660-4)

[ Quellcode: embassy-domalign  ]

Zusätzliche EMBOSS-Befehle für Alignments mit Proteindomänen

Die DOMALIGN-Programme wurden von Jon Ison et al. am MRC HGMP für deren Forschung im Bereich der Proteindomänen entwickelt. Diese Programme sind als ein EMBASSY-Paket enthalten, die Entwicklung ist jedoch noch nicht abgeschlossen.

Anwendungen der aktuellen domalign-Veröffentlichung sind allversusall (Daten von Sequenzähnlichkeiten von einem Alle-gegen-Alle-Vergleich), domalign (erstellt Alignments (DAF-Datei) für Knoten in einer DCF-Datei), domainrep (sortiert DCF-Dateien neu, um repräsentative Strukturen zu identifizieren) und seqalign (erweitert Alignments (DAF-Datei) mit Sequenzen (DHF-Datei)).

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Implementiert in: implemented-in::c, interface::commandline, Rolle: Programm, Zweck: Hilfswerkzeug, Anwendungs-Suite: suite::TODO, use::analysing, Zweck: Vergleichen, Bearbeiten, Unterstützt Formate: works-with-format::TODO, works-with-format::plaintext, Arbeitet mit: Benötige eine zusätzliche Markierung

Andere Pakete mit Bezug zu embassy-domalign

• dep: emboss-lib (<< 6.6.1~)

  EMBOSS-Bibliotheken

  dep: emboss-lib (>= 6.6.0+dfsg)

• dep: libc6 (>= 2.4)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libx11-6

  Clientseitige X11-Bibliothek

• rec: emboss

  Europäische, quelloffene Software-Suite für Molekularbiologie

• sug: embassy

  Paket nicht verfügbar

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Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
i386	67,1 kB	601,0 kB	[Liste der Dateien]