Paket: arb (6.0.6-5) [non-free]

[ Quellcode: arb  ]

phylogenetic sequence analysis suite - main program

ARB is a graphical suite of tools for sequence database handling and data analysis. A central database of processed (aligned) sequences and any type of additional data linked to the sequence entries is structured according to phylogeny or other user-defined criteria.

The ARB project (from the Latin "arbor", a tree) is a joint initiative of the Lehrstuhl für Mikrobiologie and the LRR of the Technische Universität München in 1992. Since 2014 the ARB project is continued by the Department of Molecular Ecology http://www.mpi-bremen.de/en/Department_of_Molecular_Ecology.html at the Max Planck Institute for Marine Microbiology in Bremen in cooperation with Ribocon GmbH http://www.ribocon.com .

Markierungen: Implementiert in: C, Benutzer-Schnittstellen: Graphical User Interface, X-Window-System, Rolle: role::program, uitoolkit::motif, GUI-Baukasten: X-Bibliothek, X-Window-System: Anwendung

Andere Pakete mit Bezug zu arb

• dep: arb-common (= 6.0.6-5)

  phylogenetic sequence analysis suite - common files

• dep: fastdnaml

  Werkzeug zum Aufbau phylogenetischer Bäume von DNA-Sequenzen

• dep: fig2dev

  Hilfsprogramme zum Konvertieren von Dateien mit XFig-Abbildungen

• dep: libarb (= 6.0.6-5)

  phylogenetic sequence analysis suite - libraries

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: libtirpc3 (>= 1.0.2)

  Transportunabhängige RPC-Bibliothek

• dep: libxm4 (>= 2.3.3)

  Motif - X/Motif-Laufzeitbibliothek

• dep: libxt6

  X11-Bibliothek mit wesentlichen Werkzeugen

• dep: mafft

  Programm für multiples Alignment von Aminosäure- oder Nukleotidsequenzen

• dep: mrbayes

  Bayessche Inferenz der Phylogenie

• dep: openssh-client

  Secure Shell (SSH) Client, für den sicheren Zugang zu entfernten Rechnern

• dep: phylip

  package of programs for inferring phylogenies

• dep: phyml

  Phylogenetic estimation using Maximum Likelihood

• dep: raxml

  Randomized Axelerated Maximum Likelihood of phylogenetic trees

• dep: readseq

  Umwandlung von Sequenzformaten

• dep: tree-puzzle

  Rekonstruktion phylogenetischer Bäume durch »Maximum Likelihood«

• dep: xdg-utils

  Desktop-Integrationsprogramme von freedesktop.org

• rec: bioperl

  Perl-Werkzeuge für bioinformatische Anwendungen

• rec: xfig

  Vektororientiertes Zeichenprogramm für X11

• sug: arb-database

  Paket nicht verfügbar

• sug: gnuplot

  Kommandozeilengesteuertes, interaktives Plot-Programm
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11

• sug: gv

  PostScript- und PDF-Betrachter für X

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Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
i386	2.001,8 kB	7.340,0 kB	[Liste der Dateien]