Alle Optionen
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Quellcode: boxshade  ]

Paket: boxshade (3.3.1-14)

Links für boxshade

Screenshot

Debian-Ressourcen:

Quellcode-Paket boxshade herunterladen:

Betreuer:

Externe Ressourcen:

Ähnliche Pakete:

Pretty-printing von multiplen Sequenzalignments

Boxshade erstellt gut aussehende Darstellungen von Alignments von Protein- oder DNA-Sequenzen. Das Programm alignt die Sequenzen nicht selbst, sondern benötigt als Eingabe eine Datei, die automatisch von einem Programm für Multiple Alignments oder manuell mit einem Alignment-Editor erstellt wurde.

Boxshade liest Alignments in den Formaten PILEUP-MSF, CLUSTAL-ALN, MALIGNED-data und ESEE-save (bis zu 150 Sequenzen von maximal je 10000 Elementen). Verschiedene Regeln für die Schattierung und Färbung werden angeboten, um biochemische Ähnlichkeiten der Seitenketten in den Spalten zu reflektieren. Die Ausgabe erfolgt auf den Bildschirm oder in eine Datei. Angeboten werden die Formate ANSI/VT100, PS/EPS, RTF, HPGL, ReGIS, LJ250-printer, ASCII, xFIG, PICT und HTML.

Markierungen: Biologie: Clustal/ALN, Proteine, Feld: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implementiert in: implemented-in::c, interface::commandline, Rolle: Programm, Zweck: scope::utility, use::typesetting, Unterstützt Formate: works-with-format::html, works-with-format::plaintext, works-with-format::postscript, works-with-format::tex, Arbeitet mit: Benötige eine zusätzliche Markierung, Text

Andere Pakete mit Bezug zu boxshade

  • hängt ab von
  • empfiehlt
  • schlägt vor
  • erweitert

boxshade herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur Paketgröße Größe (installiert) Dateien
armhf 52,9 kB135,0 kB [Liste der Dateien]