Paket: sibsim4 (0.20-5)

[ Quellcode: sibsim4  ]

Richtet exprimierte RNA-Sequenzen an einer DNA-Vorlage aus

Das SIBsim4-Projekt basiert auf sim4, einem Programm, das entwickelt wurde, um eine exprimierte DNA-Sequenz mit einer genomischen Sequenz abzustimmen um Intronen zu erlauben. SIBsim4 ist eine recht umfangreiche Neuerstellung des ursprünglichen Codes mit den folgenden Zielen:

 * Geschwindigkeitsverbesserung;
 * Einsetzbarkeit auf großen (Größenordnung von Chromosomen)
   DNA-Sequenzen;
 * detailliertere Ausgabe über Spleiß-Typen;
 * detailliertere Ausgabe über Poly(A)-Schwänze;
 * verschiedene Aufräumarbeiten und Verbesserungen des Codes.

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Implementiert in: implemented-in::c, interface::commandline, Rolle: Programm, Zweck: Hilfswerkzeug, Zweck: use::TODO, use::comparing, Suchen, Unterstützt Formate: works-with-format::TODO, works-with-format::plaintext, Arbeitet mit: Benötige eine zusätzliche Markierung

Andere Pakete mit Bezug zu sibsim4

• dep: libc6 (>= 2.4)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

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Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
armel	27,5 kB	72,0 kB	[Liste der Dateien]