Paket: hyphy-pt (2.5.47+dfsg-1)

[ Quellcode: hyphy  ]

Hypothesentest unter Verwendung von Phylogenie (pthreads-Version)

HyPhy ist ein quelloffenes Softwarepaket für die Analyse genetischer Sequenzen unter Verwendung phylogenetischer Techniken, molekularer Evolution und maschinellem Lernen. Es beinhaltet eine komplette grafische Benutzeroberfläche (GUI) und eine mächtige Skriptsprache für grenzenlose Anpassungsmöglichkeiten der Analysen. Zusätzlich unterstützt HyPhy Umgebungen für parallele Datenverarbeitung (via einer Schnittstelle für den Nachrichtenaustausch) und kann als Laufzeitbibliothek kompiliert und von anderen Programmierumgebungen, wie Python oder R, aufgerufen werden. Die Weiterentwicklung von HyPhy wird momentan teilweise von einem Forschungsprojekt-Zuschuss der NIGMS (1R01GM093939) unterstützt.

Dieses Paket enthält eine Ausführung mit pthreads für Simultanverarbeitung.

Andere Pakete mit Bezug zu hyphy-pt

• dep: hyphy-common (= 2.5.47+dfsg-1)

  Hypothesentest unter Verwendung von Phylogenie (gemeinsame Dateien)

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libcurl3-gnutls (>= 7.16.2)

  Einfach nutzbare Client-Bibliothek für URL-Übertragungen (GnuTLS-Variante)

• dep: libgcc-s1 (>= 3.5)

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libgomp1 (>= 6)

  Unterstützungsbibliothek für GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  Laufzeit-Bibliothek für SQLite 3

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.11.dfsg)

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

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