Paket: cassiopee (1.0.9-3 und andere)

[ Quellcode: cassiopee  ]

index and search tool in genomic sequences

Cassiopee index and search library C implementation. It is a complete rewrite of the ruby Cassiopee gem. It scans an input genomic sequence (dna/rna/protein) and search for a subsequence with exact match or allowing substitutions (Hamming distance) and/or insertion/deletions.

This package contains the cassiopee and cassiopeeknife tools.

Andere Pakete mit Bezug zu cassiopee

• dep: libc6 (>= 2.4)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libcassie1v5 (>= 1.0.9)

  library implementating search algorithms

• dep: libgcc-s1 (>= 3.5)

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libgoogle-glog0v6 (>= 0.6.0~rc1)

  Bibliothek, die auf der Anwendungsebene protokolliert

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
armel	1.0.9-3+b2	16,3 kB	54,0 kB	[Liste der Dateien]