[ Quellcode: ampliconnoise ]
Paket: ampliconnoise (1.29-10 und andere)
Links für ampliconnoise
Debian-Ressourcen:
Quellcode-Paket ampliconnoise herunterladen:
Betreuer:
- Debian Med Packaging Team (QS-Seite, E-Mail-Archiv)
- Tim Booth (QS-Seite)
- Andreas Tille (QS-Seite)
- Pranav Ballaney (QS-Seite)
Externe Ressourcen:
- Homepage [github.com]
Ähnliche Pakete:
removal of noise from 454 sequenced PCR amplicons
AmpliconNoise is a package of applications to clean up high-throughput sequence data. It consists of three main parts:
Pyronoise - does flowgram-based clustering to spot misreads SeqNoise - removes PCR point mutations Perseus - removes PCR chimeras without the need for a set of reference sequences
Previously there was a standalone "Pyronoise" by the same authors and this package includes an updated version. There is also a "Denoiser" in Qiime which is related but distinct.
Andere Pakete mit Bezug zu ampliconnoise
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
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- dep: libgsl27 (>= 2.7.1)
- GNU Scientific Library -- Bibliothekspaket
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- dep: libopenmpi3 (>= 4.1.4)
- Leistungsstarke Message-Passing-Bibliothek - Laufzeitbibliotheken
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- dep: mafft
- Programm für multiples Alignment von Aminosäure- oder Nukleotidsequenzen
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- rec: openmpi-bin
- Leistungsstarke Message-Passing-Bibliothek - Programmdateien
ampliconnoise herunterladen
| Architektur | Version | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 1.29-10+b2 | 1.085,5 kB | 2.041,0 kB | [Liste der Dateien] |