Paket: libhtsjdk-java (3.0.4+dfsg-2)

Links für libhtsjdk-java

Debian-Ressourcen:

Quellcode-Paket htsjdk herunterladen:

Betreuer:

Debian Med Packaging Team (QS-Seite, E-Mail-Archiv)
Charles Plessy (QS-Seite)
Olivier Sallou (QS-Seite)
Vincent Danjean (QS-Seite)
Andreas Tille (QS-Seite)
Pierre Gruet (QS-Seite)

Externe Ressourcen:

Homepage [samtools.github.io]

Java API for high-throughput sequencing data (HTS) formats

HTSJDK is an implementation of a unified Java library for accessing common file formats, such as SAM (Sequence Alignment/Map) and VCF, used for high-throughput sequencing data. There are also an number of useful utilities for manipulating HTS data.

Andere Pakete mit Bezug zu libhtsjdk-java

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libcommons-compress-java

Java-API zum Arbeiten mit Komprimierungs- und Archivformaten
dep: libcommons-jexl2-java

Apache Commons JEXL - Java Expression Language
dep: libmjson-java

lean JSON Library for Java with a compact API
dep: libngs-java

Next Generation Sequencing language Bindings (Java bindings)
dep: librhino-java

Bibliotheken für die JavaScript-Engine Rhino
dep: libsnappy-java

Snappy für Java, ein schnelles Komprimierungs-/Dekomprimierungsprogramm

sug: picard-tools

Command line tools to manipulate SAM and BAM files
sug: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

libhtsjdk-java herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
all	1.770,7 kB	1.975,0 kB	[Liste der Dateien]