Source Package: pigx-rnaseq (0.1.1-1)
Links for pigx-rnaseq
Debian Resources:
Maintainers:
External Resources:
The following binary packages are built from this source package:
- pigx-rnaseq
- pipeline for checkpointed and distributed RNA-seq analyses
Other Packages Related to pigx-rnaseq
-
- adep:
debhelper-compat
(= 13)
- Package not available
-
- adep:
autoconf-archive
- Autoconf Macro Archive
-
- adep:
fastp
- Ultrahurtig alt i en FASTQ-forbrænder
-
- adep:
fastqc
- Kvalitetskontrol for høj gennemløb af sekvensdata
-
- adep:
hisat2
- Grafbaseret sammenligning af korte nukleoide læsninger for mange genomer
-
- adep:
libjs-jquery-datatables
- jQuery-udvidelsesmodul der laver pæne tabeller fra forskellige datakilder
-
- adep:
libjs-jquery-tablesorter
- Fleksibel klientorienteret tabelsortering - jQuery-udv.modul
-
- adep:
megadepth
- computes coverage from BigWig and BAM sequencing files
-
- adep:
multiqc
- Vis integration for RNS-sekventering på tværs af værktøjer og prøver
-
- adep:
python3-all
- Pakke som afhænger af alle understøttede kørselstidsversioner af Python 3
-
- adep:
python3-deeptools
- Platform til at udforske biologiske deep-sequencing-data
-
- adep:
python3-htseq
- Python 3-redskaber til høj-gennemløb læseanalyse af genomsekventeringer
-
- adep:
r-bioc-deseq2
- R-pakke for RNS-Seq-differentiel udtryksanalyse
-
- adep:
r-bioc-rtracklayer
- GNU R-grænseflade til genombrowsere og deres annotationsspor
-
- adep:
r-bioc-summarizedexperiment
- BioConductor - assay-container
-
- adep:
r-bioc-tximport
- Estimater på transkriptniveau for biologisk sekventering
-
- adep:
r-cran-corrplot
- Visualisering af en korrelationsmatrix
-
- adep:
r-cran-crosstalk
- GNU R-mellem-kontrol interaktivitet for HTML-kontroller
-
- adep:
r-cran-data.table
- GNU R-udvidelse af Data.frame
-
- adep:
r-cran-dt
- GNU R-omslag for JavaScript-bibliotkeet »DataTables«
-
- adep:
r-cran-ggplot2
- Implementering af Grammar of Graphics
-
- adep:
r-cran-ggrepel
- Automatisk positionering ikkeoverlappende tekstetiketter i plot
-
- adep:
r-cran-gprofiler2
- Interface to the 'g:Profiler' Toolset
-
- adep:
r-cran-ggpubr
- GNU R ggplot2-baseret udgivelsesplot
-
- adep:
r-cran-locfit
- GNU R local regression, likelihood and density estimation
-
- adep:
r-cran-pheatmap
- GNU R-pakke til at oprette smukke varmekort
-
- adep:
r-cran-plotly
- Opret interaktiv internetgrafik via »plotly.js« i GNU R
-
- adep:
r-cran-reshape2
- Fleksibelt omdanne data - en genstart af pakken reshape
-
- adep:
r-cran-rjson
- GNU R-pakke til at konvertere mellem R- og JSON-objekter
-
- adep:
r-cran-rlang
- Funktioner for basistyper samt Core R- og »Tidyverse«-funktioner
-
- adep:
r-cran-rmarkdown
- convert R markdown documents into a variety of formats
-
- adep:
r-cran-scales
- Skaler funktioner for visualisering
-
- adep:
salmon
- Wicked-hurtig transskriptkvantificering fra RNA-seq-data
-
- adep:
samtools
- Forarbejdning af sekvensopstillinger i SAM-, BAM- og CRAM-formater
-
- adep:
snakemake
- Pythonisk system for håndtering af arbejdsforløb
-
- adep:
trim-galore
- Automatiser kvalitet og adaptertilpasning for DNA-sekventering
