[ Source: python-seqcluster ]
Package: python3-seqcluster (1.2.9+ds-3) [contrib]
Links for python3-seqcluster
Debian Resources:
Download Source Package python-seqcluster:
- [python-seqcluster_1.2.9+ds-3.dsc]
- [python-seqcluster_1.2.9+ds.orig.tar.xz]
- [python-seqcluster_1.2.9+ds-3.debian.tar.xz]
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
analysis of small RNA in NGS data
Identifies small RNA sequences of all sorts in RNA sequencing data. This is especially helpful for the identification of RNA that is neither coding nor belonging to the already well-established group of miRNA, towards many tools feel constrained to.
This package provides the Python module. For executables see the package 'seqcluster'.
Other Packages Related to python3-seqcluster
|
|
|
|
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- dep: python3-colorlog
- Formateringsprogram til brug med logningsmodulet for Python 3
-
- dep: python3-mirtop
- Annoter miRNA'er med en mirna/isomir-navngivning - Python 3
-
- dep: python3-myst-parser
- Rig og udvidelig variant af Markdown for tekniske dokumenter
-
- dep: python3-nose2
- Næste generation af pænere test for Python 3
-
- dep: python3-numpy
- Hurtig tabelfacilitet til Python 3-sproget
-
- dep: python3-pandas
- Datastrukturer for »relationelle« data eller »etiketdata«
-
- dep: python3-progressbar
- Tekststatusbjælkebibliotek for Python - Python 3
-
- dep: python3-pybedtools
- Python 3-omslag omkring BEDTools for bioinformatikarbejde
-
- dep: python3-pysam
- Grænseflade for SAM/BAM-sekvenssammenligning og oversættelsesformatet - Python 3
-
- dep: python3-scipy
- Videnskabelige værktøjer for Python 3
-
- dep: python3-yaml
- YAML-fortolker og udleder for Python 3
-
- rec: bedtools
- Programpakke med redskaber for sammenligning af arvemassefunktioner
-
- rec: fastqc
- Kvalitetskontrol for høj gennemløb af sekvensdata
-
- rec: libjs-bootstrap
- HTML, CSS og JS-ramme
-
- rec: libjs-jquery
- JavaScript-bibliotek for dynamiske internetprogrammer
-
- rec: libjs-jquery-datatables
- jQuery-udvidelsesmodul der laver pæne tabeller fra forskellige datakilder
-
- rec: libjs-jquery-tablesorter
- Fleksibel klientorienteret tabelsortering - jQuery-udv.modul
-
- rec: libjs-jquery-ui
- Brugerfladebibliotek til JavaScript for dynamiske internetprogrammer
-
- rec: mirtop
- Mærk miRNA'er med et standardnavn mirna/isomir
-
- rec: python3-cutadapt
- Rens biologiske sekvenser fra sekvenslæsninger med høj gennemløb - Python 3
-
- rec: python3-dateutils
- Package not available
-
- rec: python3-tz
- Python3-version af tidszonedatabasen Olson
-
- rec: r-bioc-degreport
- BioConductor - rapport over DEG-analyser
-
- rec: r-bioc-deseq2
- R-pakke for RNS-Seq-differentiel udtryksanalyse
-
- rec: r-bioc-edger
- Empirisk analyse af digitale gen-udtryksdata i R
-
- rec: r-bioc-htsfilter
- GNU R-filter replikeret høj-gennemløb transkriptom sekventeringsdata
-
- rec: r-cran-devtools
- Værktøjer til at gøre udvikling af R-pakker hurtigere
-
- rec: r-cran-dplyr
- GNU R-grammatik for datamanipulering
-
- rec: r-cran-ggplot2
- Implementering af Grammar of Graphics
-
- rec: r-cran-gplots
- GNU R-pakke med værktøjer for plot af data af Greg Warnes m.fl.
-
- rec: r-cran-gridextra
- GNU R-pakke med udvidelser for pakken grid
-
- rec: r-cran-gtools
- GNU R-pakke med R-programmeringsværktøjer af Greg Warnes med flere
-
- rec: r-cran-knitr
- GNU R-pakke for dynamisk rapportoprettelse via Literate Programming
-
- rec: r-cran-pheatmap
- GNU R-pakke til at oprette smukke varmekort
-
- rec: r-cran-reshape
- Flexibly reshape data
-
- rec: rna-star
- Ultrahurtig univerel RNA-seq-sammenligningsprogram
-
- rec: samtools
- Forarbejdning af sekvensopstillinger i SAM-, BAM- og CRAM-formater
-
- rec: vienna-rna
- RNA sequence analysis
-
- sug: seqcluster
- analysis of small RNA in NGS data
Download python3-seqcluster
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| all | 1,604.3 kB | 108,045.0 kB | [list of files] |