Package: mcaller (1.0.3+git20210624.b415090-3)

[ Source: mcaller  ]

find methylation in nanopore reads

   H
   |
 H-C-aller
   |
   H

This program is designed to call m6A from nanopore data using the differences between measured and expected currents.

Other Packages Related to mcaller

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: python3-biopython

  Python 3-bibliotek for bioinformatik

• dep: python3-h5py

  Almene Pythongrænseflader til hdf5

• dep: python3-matplotlib

  Pythonbaseret plotsystem i en stil svarende til Matlab - Python 3

• dep: python3-numpy

  Hurtig tabelfacilitet til Python 3-sproget

• dep: python3-pandas

  Datastrukturer for »relationelle« data eller »etiketdata«

• dep: python3-pysam

  Grænseflade for SAM/BAM-sekvenssammenligning og oversættelsesformatet - Python 3

• dep: python3-scipy

  Videnskabelige værktøjer for Python 3

• dep: python3-seaborn

  Statistisk visualiseringsbibliotek for Python 3

• dep: python3-sklearn

  Pythonmoduler for maskinlæring og dataundersøgelse - Python 3

• rec: nanopolish

  Konsensuskalder for nanopore-sekvensdata

  or poretools

  Værktøjssæt til nanopores nukleotidsekventeringsdata

• sug: bwa

  Burrows-Wheeler Aligner (sekvenssammenligner)

• sug: graphmap

  Package not available

Download mcaller

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	18.5 kB	83.0 kB	[list of files]